历时15个月 云南怒江草果全基因组邃密图谱绘制成功
原标题:历时15个月 云南怒江草果全基因组邃密图谱绘制成功

从20世纪70年代开起,云南省怒江州就开起种植草果,到2020年,种植面积已达111万亩,不光是全国草果的中央产区,也是当地群多脱贫致富的主要经济作物。


为了添快挑高草果遗传改良效果,造就高产、抗病、优质、坦然新品栽,对从源头创新保障草果产业健康可不息发展,2019年9月,怒江州说相符华南农业大学等国内表高校科研院所机构,正式启行草果全基因组测序计划,历时1年零3个月,成功完善草果全基因组测序做事,绘制了邃密图谱,并于1月13日正式对表发布。

议定Nanopore及illumina等测序技术,拼接拼装得到2.08G大幼的基因组,拼装出由1145个contig序列构成的草果参考基因组序列,GC含量为40.9%,最长的contig长度为31.6Mb,N50为4.7Mb。结相符HiC测序效果,得到24对染色体的高质量基因组,包括42394个基因。议定转录组、代谢组有关分析,得到草果关键香气物质相符成的候选基因一批。草果全基因组邃密图谱完善将极大推行草果的全基因组精准育栽,为打造国家级草果栽质资源圃挑供主要基础作用。(总台央视记者 刘文杰)